Domowe komputery w służbie nauki

Nie od dziś internauci mogą uczestniczyć w różnych projektach, które pozwalają na oddanie mocy obliczeniowej swojego komputera dla celów naukowych. Prekursorem takiej  "rozproszonej pracy" nad różnego rodzaju inicjatywami był projekt SETI@home mający na celu szukanie życia pozaziemskiego. Były jednak również inne projekty np. - Rosetta@home, który zajmował się badaniami nad rozpoznawaniem trójwymiarowych kształtów białek, które mają pomóc w opracowywaniu lekarstw na poważne schorzenia.

Szczególnie radosny jest ten moment, gdy prowadzone prace przynoszą efekty. 4 grudnia bioinformatycy z hiszpańskiego Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques i Uniwersytetu Pompeu Fabrs dokonali symulacji procesu dojrzewania i rozprzestrzeniania się wirusa powodującego AIDS.

W badaniach wykorzystano otwartą platformę rozproszonych obliczeń GPUGRID.net, która jest oparta na procesorach graficznych "zwykłych użytkowników". Inicjatywa ma wsparcie firm AMD oraz NVIDIA.

Szansa na nowe leki

Naukowcom z pomocą zasobów obliczeniowych wielu komputerów udało się odtworzyć mechanizm przekształcania nowo utworzonych, niegroźnych cząsteczek w zaraźliwe wirusy, który jest niezbędnym elementem procesu reprodukcji HIV. Wyniki badań zostały opublikowane w najnowszym wydaniu dziennika PNAS i mogą znacząco wpłynąć na rozwój leków antyretrowirusowych.

Naukowcy wykorzystali "ochotnicze" możliwości obliczeniowe do przetworzenia ogromnych ilości danych i wygenerowania złożonych symulacji molekularnych. W tym konkretnym przypadku wykonano tysiące symulacji komputerowych; każda symulacja obejmowała setki nanosekund (miliardowe części sekundy), a łącznie zasymulowano prawie całą milisekundę procesu.

Odkrycie może otworzyć drogę do tworzenia leków wykorzystujących działanie nowo odkrytych mechanizmów molekularnych.

Poniżej film przedstawiający symulację: